Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOBEC3FQ8IUX4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOBEC3FQ8IUX4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3FQ8IUX4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBEC3FQ8IUX4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms