Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATAD2AQ86YP4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATAD2AQ86YP4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GATAD2AQ86YP4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms