Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDSS2Q86YH6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDSS2Q86YH6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDSS2Q86YH6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDSS2Q86YH6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDSS2Q86YH6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDSS2Q86YH6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDSS2Q86YH6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms