Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SFR1Q86XK3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFR1Q86XK3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFR1Q86XK3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms