Protein–RNA interactions for Protein: Q86W67

FAM228A, Protein FAM228A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228AQ86W67 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FAM228AQ86W67 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM228AQ86W67 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM228AQ86W67 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FAM228AQ86W67 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM228AQ86W67 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM228AQ86W67 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM228AQ86W67 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM228AQ86W67 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM228AQ86W67 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM228AQ86W67 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM228AQ86W67 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM228AQ86W67 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM228AQ86W67 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM228AQ86W67 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM228AQ86W67 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms