Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV6

TRIM74, Tripartite motif-containing protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM74Q86UV6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM74Q86UV6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM74Q86UV6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM74Q86UV6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM74Q86UV6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM74Q86UV6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM74Q86UV6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM74Q86UV6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM74Q86UV6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms