Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAINQ86UA6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAINQ86UA6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAINQ86UA6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms