Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF550Q7Z398 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF550Q7Z398 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms