Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTZ2

USP17L1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1Q7RTZ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP17L1Q7RTZ2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP17L1Q7RTZ2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
USP17L1Q7RTZ2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L1Q7RTZ2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L1Q7RTZ2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L1Q7RTZ2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L1Q7RTZ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP17L1Q7RTZ2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP17L1Q7RTZ2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP17L1Q7RTZ2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
USP17L1Q7RTZ2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L1Q7RTZ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L1Q7RTZ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP17L1Q7RTZ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L1Q7RTZ2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L1Q7RTZ2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L1Q7RTZ2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L1Q7RTZ2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L1Q7RTZ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L1Q7RTZ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L1Q7RTZ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L1Q7RTZ2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L1Q7RTZ2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms