Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SV2BQ7L1I2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SV2BQ7L1I2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SV2BQ7L1I2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SV2BQ7L1I2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms