Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHSY3Q70JA7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHSY3Q70JA7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHSY3Q70JA7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms