Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP45Q70EL2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP45Q70EL2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP45Q70EL2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP45Q70EL2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP45Q70EL2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP45Q70EL2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP45Q70EL2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP45Q70EL2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP45Q70EL2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP45Q70EL2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms