Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPGS1Q6ZTW0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPGS1Q6ZTW0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms