Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCNT7Q6ZNI0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCNT7Q6ZNI0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GCNT7Q6ZNI0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCNT7Q6ZNI0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCNT7Q6ZNI0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCNT7Q6ZNI0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT7Q6ZNI0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCNT7Q6ZNI0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT7Q6ZNI0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms