Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CASC2Q6XLA1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms