Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINGO4Q6UY18 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LINGO4Q6UY18 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINGO4Q6UY18 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms