Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALKAL1Q6UXT8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALKAL1Q6UXT8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALKAL1Q6UXT8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms