Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB35

MTHFD1L, Monofunctional C1-tetrahydrofolate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1LQ6UB35 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFD1LQ6UB35 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTHFD1LQ6UB35 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTHFD1LQ6UB35 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MTHFD1LQ6UB35 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms