Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C22orf39Q6P5X5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C22orf39Q6P5X5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms