Protein–RNA interactions for Protein: Q6P499

NIPAL3, NIPA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL3Q6P499 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NIPAL3Q6P499 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPAL3Q6P499 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms