Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC42EP5Q6NZY7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDC42EP5Q6NZY7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms