Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRNP1Q6NT89 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRNP1Q6NT89 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRNP1Q6NT89 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRNP1Q6NT89 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms