Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF6Q6KF10 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GDF6Q6KF10 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDF6Q6KF10 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GDF6Q6KF10 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms