Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT80Q6KB66 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT80Q6KB66 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms