Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCSD1Q6JBY9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RCSD1Q6JBY9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms