Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD2BQ6EKJ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms