Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REP15Q6BDI9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REP15Q6BDI9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms