Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TXNDC8Q6A555 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TXNDC8Q6A555 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNDC8Q6A555 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms