Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
CARMIL1Q5VZK9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
CARMIL1Q5VZK9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CARMIL1Q5VZK9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
CARMIL1Q5VZK9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms