Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTUD1Q5VV17 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUD1Q5VV17 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms