Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPO2Q5TGU0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPO2Q5TGU0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms