Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM78Q5T7P6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms