Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP58Q5T655 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP58Q5T655 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP58Q5T655 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP58Q5T655 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms