Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C10orf55Q5SWW7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C10orf55Q5SWW7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms