Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAPCD1Q5SSQ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms