Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSL3PQ5NE16 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSL3PQ5NE16 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms