Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FBXO47Q5MNV8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO47Q5MNV8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms