Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
AMER1Q5JTC6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
AMER1Q5JTC6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
AMER1Q5JTC6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
AMER1Q5JTC6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
AMER1Q5JTC6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
AMER1Q5JTC6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
AMER1Q5JTC6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
AMER1Q5JTC6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
AMER1Q5JTC6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
AMER1Q5JTC6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
AMER1Q5JTC6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
AMER1Q5JTC6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
AMER1Q5JTC6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
AMER1Q5JTC6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
AMER1Q5JTC6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms