Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB41Q5JT25 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB41Q5JT25 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB41Q5JT25 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB41Q5JT25 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB41Q5JT25 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB41Q5JT25 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB41Q5JT25 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms