Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9U9

DDX60L, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX60-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX60LQ5H9U9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX60LQ5H9U9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX60LQ5H9U9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX60LQ5H9U9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX60LQ5H9U9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX60LQ5H9U9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX60LQ5H9U9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX60LQ5H9U9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX60LQ5H9U9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms