Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH70

XKR9, XK-related protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR9Q5GH70 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XKR9Q5GH70 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XKR9Q5GH70 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
XKR9Q5GH70 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms