Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BRDTQ58F21 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRDTQ58F21 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRDTQ58F21 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms