Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CDCA8Q53HL2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDCA8Q53HL2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDCA8Q53HL2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDCA8Q53HL2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms