Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4orf46Q504U0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf46Q504U0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms