Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC25A52Q3SY17 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC25A52Q3SY17 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC25A52Q3SY17 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC25A52Q3SY17 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC25A52Q3SY17 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC25A52Q3SY17 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC25A52Q3SY17 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC25A52Q3SY17 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A52Q3SY17 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A52Q3SY17 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms