Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP13-4Q3LI77 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms