Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPRED3Q2MJR0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPRED3Q2MJR0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRED3Q2MJR0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms