Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF4Q2M2E3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ODF4Q2M2E3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms