Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UPP1Q16831 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UPP1Q16831 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
UPP1Q16831 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms