Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTN1Q16799 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RTN1Q16799 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms